• "Carta de Fundación y Dotación de San Lorenzo el Real, 22-IV-1567. Estudio crítico", en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 197 (1984) 296-382.

• "Realidad histórica y latido metahistórico". Notas para seis reflexiones sobre El Escorial, en Nueva Etapa (San Lorenzo del Escorial), Época III, nº 50-51 (1985) 11-27.

• "Institución, mentalidad e historia". Cien años de presencia agustiniana en el Monasterio del Escorial, vistos a través de la revista 'La Ciudad de Dios', en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 198 (1985) 553-632.

• "Las pinturas de la escalera imperial del Escorial", en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 199 (1986) 253-300.

• "'Combinación de monedas y cálculo manifiesto', del P. Antonio Soler. Transcripción del Ms. escurialense H I 15, con introducción y notas", en Anuario Jurídico Escurialense (San Lorenzo del Escorial), 17-18 (1985-1986), t. II, 525-602.

• “Dos historiadores jerónimos del siglo XVIII: los padres Francisco Salgado y Juan Núñez”, en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 201 (1988) 5-34.

• "La Orden de San Jerónimo en Hispanoamérica: análisis político, religioso y socioeconómico de unas experiencias", en Studia Monastica (Abadía de Montserrat, Barcelona), 30 / 2 (1988) 305-338.

• "Repercusiones de la Guerra de la Independencia en El Escorial", en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 202 (1989) 313-364.

• Un manchego en los orígenes del Escorial: Fray Hernando de Ciudad Real, tercer prior (1571 1575). Discurso de ingreso en el Instituto de Estudios Manchegos, Ciudad Real 1989, 60 pp.

• "La pintura al fresco de Lucas Jordán en el Monasterio del Escorial", en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 203 (1990) 69- 88.

• "La Corte y la Comunidad en las 'jornadas' anuales del Real Sitio de San Lorenzo", en La Música en el Monasterio del Escorial. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 1993, pp. 145-168.

• "Dos monasterios gemelos: Sta. María de Guadalupe y San Lorenzo del Escorial", en Guadalupe (Monasterio de Guadalupe, Cáceres), nº 726 (1994) 105-117.

• "La langosta y el monasterio de Guadalupe: Actos religiosos celebrados en la plaga de 1755", en Guadalupe (Monasterio de Guadalupe, Cáceres), nº 728 (1994) 19-35.

• "Prólogo" a La Enfermería Jerónima del Monasterio del Escorial (Su historia y vicisitudes durante el reinado de Felipe II), San Lorenzo del Escorial 1995, pp. 7-12.

• "La vida cotidiana en el Monasterio de San Lorenzo el Real del Escorial a fines del Antiguo Régimen (1780-1830)", en Monjes y Monasterios Españoles. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 1995, t. III, pp. 833-903.

• "La vida y el ambiente cotidiano en el Escorial durante la época del 'Tratado de San Lorenzo', 27-X-1795", en Anuario Jurídico y Económico Escurialense (San Lorenzo del Escorial), 29 (1996) 893-926.

• "El Escorial y la imagen de la fiesta barroca", en Literatura e Imagen en El Escorial. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 1996, pp. 337-404.

• "La Congregación de San Cayetano y Animas del Real Sitio de San Lorenzo del Escorial (Siglos XVII-XIX)", en Religiosidad popular en España. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 1997, t. I, pp.  235-263.

• "'Nueva Etapa'. Cien años de una revista de jóvenes universitarios", en Nueva Etapa (San Lorenzo del Escorial), nº 65 (1998) 11-126. Número conmemorativo del I Centenario.

• "Felipe II, el monasterio del Escorial y el Nuevo Rezado (1573-1598)", en Felipe II y su época. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 1998, t. II, pp. 505-548.

• Quinta Parte de la Historia de la Orden de San Jerónimo /1676-1777), del P. Juan Núñez, OSH. Edición, transcripción, introducción y notas. San Lorenzo del Escorial 1999, 2 vols.

• "La España de Carlos II vista desde el panteón de Reyes del Escorial", en Anuario Jurídico y Económico Escurialense (San Lorenzo del Escorial), 33 (2000) 663-695.

• “Estudio preliminar” a la Historia de la Orden de San Jerónimo, del P. J. de Sigüenza. Valladolid 2000, t. I, pp. 7-43.

• “Cervantes, Lepanto y El Escorial. (Nueva interpretación de la historiografía clásica sobre la Relación existente entre la batalla naval y el Monasterio, a la luz de los documentos de la época y del propio testimonio de Cervantes), en Volver a Cervantes. Actas del IV Congreso Internacional de la Asociación de Cervantistas (Lepanto, 1/8-X-2000), Palma de Mallorca 2001, t. I, pp. 3-24.

• “Los frescos de la Sala de Batallas”, en El Monasterio del Escorial y la Pintura. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 2001, pp. 165-209.

• “El Monasterio del Escorial en la historiografía jerónima de la primera época (siglo XVI)”, en El Monasterio del Escorial y la Arquitectura. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 2002, pp. 175-243.

• “Doscientos años de Vela al Santísimo Sacramento en el Monasterio del Escorial (siglos XVII-XVIII)”, en Religiosidad y ceremonias en torno a la Eucaristía. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 2003, t. I, pp. 7-70.

• “Cofradías urbanas del Santísimo Sacramento en el Real Sitio de San Lorenzo y Villa del Escorial”, en Religiosidad y ceremonias en torno a la Eucaristía. Actas del Simposium. San Lorenzo del Escorial 2003, t. I, pp. 253-278.

• “Fiestas barrocas celebradas en Potosí en honor de la Virgen de Guadalupe de Extremadura, en 1600 y 1601”, en Las Advocaciones Marianas de Gloria. Actas del I Congreso Nacional, Córdoba 2003, t. I, pp. 135-149.

• “Guadalupe en la fe de Extremadura y en la evangelización del Nuevo Mundo”, en Congreso Mariano Guadalupense, Sevilla 2004, pp. 205-251.

• “La crisis del P. Antonio Soler, OSH (1778)”, en  Vida y Crisis del Padre Antonio Soler (1729-1783). Documentos, Madrid 2004, pp. 105-164.

• “Los monasterios españoles de jerónimas en la historiografía oficial de la orden”, en Fundadores, fundaciones y espacios de vida conventual. Nuevas aportaciones al monacato femenino. Actas del congreso, León 2005, pp. 131-162.

• “Los prólogos de las obras del P. Sigüenza: Declaración personal y mensaje institucional”, en La Ciudad de Dios (San Lorenzo del Escorial), 219 (2006) 220-250.

• “Bibliografía de y sobre el P. José de Sigüenza, OSH”, en Ibid, pp. 293-313.

• Desde mayo de 2003 a mayo de 2006 ha colaborado en el proyecto del Diccionario Biográfico Español, dirigido por la Real Academia de la Historia, con la redacción de 72 biografías, entre ellas, de importantes religiosos jerónimos del Escorial.

• “El P. Sigüenza y la Orden de San Jerónimo en el tránsito del siglo XV al XVI”, en Cuadernos de Investigación Histórica (Madrid), 23 (2006) 19-64.

• "Nueva luz para el Escorial naciente". Introducción a El Monasterio del Escorial en la 'Cámara de Castilla'. Cartas y otros documentos (1566-1579), de G. Sánchez, en Documentos para la Historia del Monasterio de San Lorenzo el Real del Escorial, vol. XIV, San Lorenzo del Escorial 2007, pp. 21-48.

• "Los reyes de España y la orden de San Jerónimo en los siglos XV-XVI", en Carlos V  en Yuste. Muerte y gloria eterna. Catálogo de la Exposi- ción, Monasterio de Yuste, 2008. Madrid 2008, pp. 113-143. Aquí se puede consultar el texto completo.

• “ La Orden de San Jerónimo y sus monasterios en las Obras de Cervantes”, en Tus obras los rincones de la literatura descubren. Actas del VI Congreso Internacional de la Asociación de Cervantistas. Alcalá de Henares 2008, pp. 201-213. Texto pinchando aquí.

• "El monje jerónimo español fray Diego Cisneros, el Santo Oficio de Lima y el Inquisidor General", en Anuario Jurídico y Económico Escurialense (San Lorenzo del Escorial), 42 (2009) 522-530. Texto completo aquí.

• "La Navidad en el Gabinete de Estampas de la Biblioteca Real del Escorial", en La Navidad: Arte, religiosidad y tradiciones populares, en San Lorenzo del Escorial 2009, pp. 377-407. Texto completo aquí.

• "Felipe II íntimo. El rey y el trabajo personal vistos a través de su correspondencia", en Cuadernos de Investigación Histórica (Madrid), 26 (2009) 21-58. Texto completo aquí.

• "Del Escorial a Lima: Fray Diego Cisneros, Bibliotecario e ilustrado", en Boletín de la Real Academia de la Historia (Madrid), 206 / 2 (2009) 177-229. Texto completo aquí.

• "Arias Montano en la Biblioteca Real y en el Gabinete de Estampas del Escorial". Texto completo de la monografía aquí. 

• "Quarta Parte de la Historia de la Orden de San Gerónimo", del P. Fco. de los Santos, con un estudio premilitar que tienen aquí.

• "Grafitos en el Real Monasterio del Escorial",  en Anuario Jurídico y Económico Escurialense (San Lorenzo del Escorial), 43 (2010) 483-510. Los interesados pueden ver aquí el texto completo.